Проект по расшифровке десяти тысяч геномов

Международная группа учёных реализует проект Genome 10K Project. Конечная цель данного проекта – создать своеобразный геномный «зоопарк», в котором будет собрана коллекция образцов расшифрованных последовательностей ДНК 10 000 видов позвоночных животных.

Сбор генетической информации будет происходить из коллекций животных в зоопарках, музеях и университетах по всему миру. После этого планируется расшифровать последовательности ДНК и попытаться выяснить степень эволюционного родства видов позвоночных животных по сравнительному анализу их геномов. Будут использованы образцы млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий и рыб, многие из которых находятся под угрозой исчезновения. Учёные попытаются также расшифровать ДНК некоторых вымерших видов по музейным образцам. Геном вида содержит информацию из прошлого, это своеобразное «молекулярное ископаемое», которое может пролить свет на эволюцию видов.

Генетики ожидают, что Genome 10K Project позволит понять генетические основы адаптивных изменений как внутривидовых, так и параллельных на межвидовом уровне. Полученные результаты можно использовать для предсказания реакций современных видов позвоночных на изменение климата, загрязнение окружающей среды, новые болезни и инвазию конкурентных видов. Это позволить усилить стратегии по охране и сохранению видов. Ещё один потенциальный аспект применения полученной информации – селекция новых сельскохозяйственных пород животных.

В Genome 10K Project, стартовавшем в апреле 2009 года принимают участие 68 учёных, специалистов в области генетики. По словам одного из ведущих участников проекта Дэвида Хаусслера, профессора биомолекулярной инженерии Калифорнийского университета и Медицинского института Говарда Хьюза, «Это уникальный шанс увидеть эволюцию в действии».

Это стало возможным благодаря настоящему прорыву последнего десятилетия в области расшифровки генома. Кроме того, что секвенирование ДНК стало быстрее и легче, эта технология ещё и стала дешевле. «Первоначально стоимость расшифровки генома человека была миллиард долларов, теперь же эта цена варьирует в районе 50 – 100 тысяч долларов», — комментирует Стивен О’Брайен из Лаборатории генетического разнообразия при Национальном институте рака (США). Например, команде профессора Стивена Квейка из Стэнфордского университета при расшифровке генома человека удалось уложиться в бюджет равный как раз 50 тысячам долларов, и не в последнюю очередь благодаря алгоритму UMKA, разработанному выпускником московскго Физтеха Дмитрием Пушкаревым.

Первые результаты работы по созданию геномного «зоопарка» были опубликованы в Journal of Heredity.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru